เทคนิคล้ำสมัยไรโบนิวคลีโอไทด์และดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์เป็นสารประกอบที่เกี่ยวข้องกัน เมื่อเซลล์คัดลอกและสร้างสายโซ่ DNA ในเซลล์แบคทีเรีย พวกมันมักจะรวมไรโบนิวคลีโอไทด์เข้ากับสาย DNA โดยไม่ตั้งใจ แทนที่ดีออกซีไรโบนิวคลีโอไทด์ เนื่องจากพวกมันแตกต่างกันด้วยอะตอมออกซิเจนเพียงอะตอมเดียวในเซลล์แบคทีเรียทำผิดพลาดประมาณ 2,000 ครั้ง
ทุกครั้งที่คัดลอกสารพันธุกรรมของเซลล์ เพื่อรักษาความสมบูรณ์ของจีโนม ไรโบนิวคลีโอไทด์จำนวนมากที่ถูกใส่ผิดที่จะถูกกำจัดออกโดยเส้นทาง RER แต่คำถามสำคัญคือวิธีที่ RNaseHII พบรอยโรคไรโบนิวคลีโอไทด์ที่ค่อนข้างหายากท่ามกลางมหาสมุทรของรหัส DNA ของเซลล์ที่ไม่เสียหายอย่างรวดเร็ว นักวิจัยใช้แมสสเปกโตรเมตรีเชิงปริมาณและการเชื่อมโยงข้ามโปรตีน-โปรตีนในร่างกายเพื่อทำแผนที่ระยะห่างระหว่างโปรตีนที่เชื่อมโยงทางเคมี และเพื่อกำหนดพื้นผิวที่สำคัญของ RNaseHII และ RNA พอลิเมอเรสขณะที่พวกมันมีปฏิสัมพันธ์ในเซลล์แบคทีเรียที่มีชีวิต ด้วยวิธีนี้พวกเขาพบว่าโมเลกุล RNaseHII ส่วนใหญ่จับคู่กับ RNA polymerase พวกเขาใช้กล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอนแบบแช่แข็ง เพื่อจับภาพโครงสร้างที่มีความละเอียดสูงของ RNaseHII ที่จับกับ RNA polymerase เพื่อเปิดเผยปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนและโปรตีนที่กำหนด RER complex การทดลองทางพันธุกรรมที่มีโครงสร้างนำทางซึ่งทำให้การทำงานร่วมกันของ RNA polymerase/RNaseHII อ่อนแอลง ทำให้ RER เสียหาย